Organismele de conducere ale Federației Filantropia sunt Adunarea Generală și Consiliul Director. Conducătorii fiecărei organizații membre formează Adunarea Generală a Federației, aprobă documentele, politicile și planurile financiare și strategice ale organizaţiei.

Dintre aceștia, 6 conducători de organizații, desemnați de către organizațiile din fiecare mitropolie de pe teritoriul Patriarhiei Române, formează Consiliul Director al Federației. Acesta este organul de conducere executivă al Federației, care coordonează activitățile acesteia între sesiunile Adunării Generale.

Preşedinte de onoare:

PREAFERICITUL PĂRINTE DANIEL, PATRIARHUL BISERICII ORTODOXE ROMÂNE

Preşedinte Federația Filantropia:

Pr. CIPRIAN ION IONIȚĂ, CONSILIER PATRIARHAL

MEMBRII CONSILIULUI DIRECTOR:

Pr. Ionuţ IORDĂCHESCU, preşedintele Fundației ”BUCURIA AJUTORULUI”

Pr. Cristian PAVEL, preşedintele Fundației ”FILANTROPIA TIMIŞOARA”

Pr. Narcis Constantin AXINTE, preşedintele Fundației ”SOLIDARITATE ȘI SPERANȚĂ”

Pr. Adrian STĂNULICĂ, preşedintele Asociației ”VASILIADA”

Dl. Liciniu CÂMPEAN, directorul Asociației ”FILANTROPICE MEDICAL-CREŞTINE CHRISTIANA”, Filiala Cluj

Pr. Ciprian CÂNDEA, președintele Asociației ”FILANTROPIA ORTODOXĂ SIBIU”